体育总局是国务院直属单位，正部级建制，实行局长负责制。体育总局与中华全国体育总会“一个机构、两块牌子”,主管体育工作。总局所属的机构包括：内设部门、直属单位和管理的全国性体育社会组织三类。

第一类、内设机构

办公厅、政策法规司、群众体育司、竞技体育司、青少年体育司、体育经济司、人事司、对外联络司、科教司、宣传司、直属机关党委、离退休干部局等12个部门。

从内设机构可以看出，核心的业务司是：群众体育司、竞技体育司、青少年体育司、体育经济司。基本上，所有涉及体育领域的重要发展事项，都能从中找到归属。

而办公厅、政策法规司、人事司、对外联络司、科教司、宣传司、直属机关党委、离退休干部局等8个部门则是担负支持保障的职能部门。

第二类、直属单位

直属单位共计42家。根据各自的职责不同，又分为三类：

1、对运动项目承担行政职能的机构。包括：冬季运动管理中心、射击射箭运动管理中心、自行车击剑运动管理中心、水上运动管理中心、举重摔跤柔道运动管理中心、拳击跆拳道运动管理中心、田径运动管理中心、游泳运动管理中心、体操运动管理中心、手曲棒垒球运动管理中心、篮球运动管理中心、排球运动管理中心、乒乓球羽毛球运动管理中心、网球运动管理中心、小球运动管理中心、航空无线电模型运动管理中心、棋牌运动管理中心、武术运动管理中心、健身气功管理中心、登山运动管理中心、汽车摩托车运动管理中心等21家。

可以看到，有些运动项目设有单独的运动管理中心，比如足球、篮球、排球。有些运动项目，则联合成立运动管理中心，比如举重、摔跤、柔道联合成立，手球、曲棍球、棒球、垒球联合成立。

显然，对于业务体量相对较小且属性相近的运动项目，实行归并管理。

2、提供训练支持保障的机构。包括：机关服务中心、财务管理和审计中心、训练局、国家奥林匹克体育中心、秦皇岛训练基地、体育科学研究所、运动医学研究所、反兴奋剂中心、体育器材装备中心、

3、承担体育交流和信息支持的机构。包括：社会体育指导中心、体育文化发展中心、体育信息中心、对外体育交流中心、人力资源开发中心、体育彩票管理中心、体育基金管理中心、中国体育报业总社。

4、体育类学校。包括：青岛航海运动学校、湛江潜水运动学校、安阳航空运动学校、北京体育大学。其中，北京体育大学实行党委领导下的校长负责制。

第三类、全国性体育社会组织

包括：中国足球协会、中国篮球协会、中国田径协会、中国滑冰协会、中国花样滑冰协会、中国冰球协会、中国马术协会、中国自行车运动协会、中国击剑协会、中国铁人三项协会、中国现代五项协会、中国帆船帆板运动协会、中国赛艇协会、中国皮划艇协会、中国摔跤协会、中国柔道协会、中国拳击协会、中国跆拳道协会、中国空手道协会、中国棒球协会、中国垒球协会、中国高尔夫协会、中国橄榄球协会、中国乒乓球协会、中国羽毛球协会、中国极限运动协会、中国围棋协会。

之前，总局的很多运动管理中心和协会属于“两块牌子、一套人马”，虽然机构得到了精简，但也存在既当裁判员又当运动员的情况，对于行业发展来说，存在一定的掣肘。

随着体制改革的深入，越来越多的运动管理中心与协会实现形式、本质上的剥离，促进各自高效履职。